肖景发, 于军 中国科学院北京基因组研究所, 中国科学院“基因组科学及信息”重点实验室 摘要  根据DNA核苷酸组分的动态变化规律将遗传密码的传统排列按密码子对GC和嘌呤含量的敏感性进行了重排. 新密...

纪念查尔斯•达尔文诞辰200周年 作者简介：龙漫远，美国芝加哥大学生态与演化学系终身教授，北京大学生物信息中心长江学者讲座教授，主要从事遗传学与演化论研究；陈振夏，北京大学生物信息中心博士研究生, 主...

科学家发现，植物中的一些微小RNA会进入人体，控制人体的基因活性，以更主动的方式影响人体。这是第一次实验证明，植物的微小RNA竟然是一个超级杀手，可以跨物种执行任务！这也许证明了“一方水土养一方人”，...

众所周知，生命起源于一个能自我复制的简单分子。——现在，我们认为我们知道怎么做出一个来。 很久以前，宇宙中产生了一颗围绕中等恒星运行的新行星，在距今40亿年前，这颗行星的表面逐渐冷却。当时，那里还是一...

人类活动不仅造成了大灭绝──我们还是存活物种进化的最大驱动力。 墨西哥的祖克(Zoque)人每年都会举行一种仪式，他们把一种有毒植物研碎、混合起来，倒进当地岩洞中的一条河里（如下图）。所有中毒而漂上水...

什么是长链非编码RNA? 长链非编码RNA（Long non-coding RNA, lncRNA）是一类本身不编码蛋白、转录本长度超过200nt的长链非编码RNA分子，它可在多层面上（表观遗传调控、...

PGAP（Pan-Genomes Analysis Pipeline） 是一款用于原核生物泛基因组学分析的自动化软件。它主要包括以下五大功能： 功能基因的聚类：根据序列相似性，将所有细菌中的功能基因按...

  (1)  DNA模板问题（关键因素） (a) 非特异PCR产物     现象：每个峰下面都有其他颜色。 原因：PCR主带与杂带混在一起测序。 对策：凝胶电泳回收主带，重新测序。 (b) 非单克隆 ...

Bootstrap又称自展法，是用小样本估计总体值的一种非参数方法，在进化和生态学研究中应用十分广泛。例如进化树分化节点的自展支持率等。 Bootstrap的思想，是生成一系列bootstrap伪样本...

第一部分       基因芯片的数据标准化(Normalization) 对基因芯片数据的标准化处理，主要目的是消除由于实验技术所导致的表达量(Intensity) 的变化，并且使各个样本(sampl...