基因组变异的理解和分析 Genomics

基因组变异的理解和分析

什么是遗传变异 遗传变异(genetic variation)是指一个群体中个体之间DNA序列的差异。变异可发生在生殖细胞(即精子和卵子)中,也发生在体细胞(所有其他)中。只有在生殖细胞中产生的变异才...
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参考基因组和基因注释文件 Genomics

参考基因组和基因注释文件

参考基因组和基因注释文件获取 通常测序生成的reads要与参考基因组或参考转录组进行比对,或Pseudo-alignment。所以首先需要获取参考基因组和参考转录组信息。 Ensembl http:/...
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BRIG-原核生物比较基因组圈图展示神器 Genomics

BRIG-原核生物比较基因组圈图展示神器

细菌基因组比较分析是时下很火热的研究方向,通过比较能够获得两个或多个基因组之间的共性及异性,在系统进化分析,物种分类鉴定,功能研究等领域中具有重要价值。 如何直观地展示基因组结构之间的相似性?BRIG...
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对应不同版本基因名称 Genomics

对应不同版本基因名称

在做生物信息分析的时候经常会遇到一种尴尬的问题就是不同来源或者版本的注释文件里面,基因名称不一致。譬如P53,其实它的标准名称为TP53。CXCR4的曾用名有一堆,CD184, D2S201E, FB...
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