DNAstar软件的使用(三)Seqman 拼接序列

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所属分类:Genomics

启动Seqman,点击面板中的Add sequence 按钮添加将要拼接的序列
DNAstar软件的使用(三)Seqman <wbr>拼接序列

选中目标序列,点击Add--Done导入目标序列

DNAstar软件的使用(三)Seqman 拼接序列 

如果导入的是峰图文件,可以双击文件名会弹出峰形图,通过移动黑色的分隔线可以去除测序质量不高的区域(黄色区域),从而避免在拼接过程中产生模棱两可的数据。

DNAstar软件的使用(三)Seqman 拼接序列

数据修正后点击Assemble即拼接,运行结束后会弹出一个新对话框,如果能拼接上,则在Contig一栏有显示。

DNAstar软件的使用(三)Seqman 拼接序列

双击Contig可以看到拼接好的完整序列,以及两个峰图的重叠区域,如果两个峰图的重叠区域完全匹配,则表明拼接的结果可靠;如果两个峰图间有不同碱基,则需要比对两个峰图,选择峰图清晰的作为最终结果。

DNAstar软件的使用(三)Seqman <wbr>拼接序列

点击文件前面的三角形可以直接查看序列的峰形图 

DNAstar软件的使用(三)Seqman 拼接序列

点击菜单栏的Contig--Save Consense--Single File 可以保存拼接好的序列。

DNAstar软件的使用(三)Seqman <wbr>拼接序列

ybzhao

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