大家对ROC曲线都很熟悉，从方法的特异性和灵敏度出发反应一个方法的准确度。但是，在临床的应用中，往往仅通过以上标准得到的准确度是不可靠的。故早在2006年纪念斯隆-凯特琳癌症中心AndrewVicke...

全外显子(Whole-exome sequencing)测序是啥？转录组(RNA-seq)测序是啥？ChIP-seq又是啥？它们之间有什么差别么？傻傻分不清，不用怕，多学习下就会了，下面让我们一起来从...

ImgaeJ是一款比较常用的科研图片分析软件，在之前已介绍过用它来进行细胞计数、不同颜色通道的荧光照片的融合和不规则区域面积的测定等（参见 拓展阅读部分）。 其实，它被广泛用于胶图条带的定量分析，如下...

随着 AlphaFold2 成为爆款功能预测软件之后，已经有不少极道科技的客户单位尝试运行过 AlphaFold2了。其实在上一篇使用篇的时候《AlphaFold2与蛋白质三维结构-使用方法》，我们已...

接着上期的AlphaFold2出现《AlphaFold2与蛋白质三维结构-背景介绍》之前，针对蛋白质结构预测领域的一些成就。其实在AlphaFold2出现之前，已经有不少相对成功的算法和应用出现了，但...

氨基酸的疏水性（Hydrophobicity）反映蛋白质的折叠情况，在潜在的跨膜区域会出现疏水区，并且在保持蛋白质的三级结构上（比如维持生物膜的结构）起重要作用。蛋白的亲疏水性（Hydropathic...

首先向大家简单介绍下GEO数据库，它是为了共享基因表达数据而建立的一个在线数据库。很多文章发表都需要上传到GEO数据库，还不赶紧学习下，(*^__^*)。 如果要上传GEO数据库，首先要建立一个NCB...

1、创建账号 如果要上传GEO数据库，首先要创建NCBI帐号， 网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/ 登录成功后，回到GEO的主页，点击 Sub...

曼哈顿距离是由十九世纪的赫尔曼·闵可夫斯基所创词汇 ，是种使用在几何度量空间的几何学用语，用以标明两个点在标准坐标系上的绝对轴距总和。 上图中红线代表曼哈顿距离，绿色代表欧氏距离，也就是直线距离，而蓝...

之前写过一篇文章Fastq-dump使用， 详细介绍了fastq-dump的用法。 虽然fastq-dump参数很多，而且一直被吐槽参数说明写的太差，但是如果真的要用起来其实也就是一行代码 fastq...