前几天在生物之窗提了一个关于利用SamTools统计reads问题，链接地址：http://home.plob.org/question/63 结合PLOB上几位网友的建议和自己收集的资料，在这里与大...

随着测序价格不断降低，二代测序的应用现在可以说是如日中天了，Hiseq，Solexa，454等等。测序数据到手之后第一件要做的事情当然是看看数据测得怎么样了？一般测序机构提供测序数据的同时也会提供一份...

1. 测序前的准备 搜集物种相关信息，比如基因组大小，杂合度， 1.1 获取基因组大小 基因组大小的获取关系到对以后组装结果的大小的正确与否判断；基因组太大（>10Gb），超出了目前denovo...

1、 -p Program Name [String] 该参数p代表的是“program”，用来选择程序。其包含五个选项： blastp、blastn、blastx、tblastn和tblastx。 ...

写这篇文章之前，我发现其实PLoB上已经有不少文章介绍blast的使用了，读者可以点击这里查看所有blast相关的文章。今天在网上看到一篇关于BLAST使用的介绍。我认为这是目前为止介绍BLAST参数...

前面已经给大家推荐了一个在线的高通量数据分析教程《推荐一个二代测序高通量数据分析在线教程》。刚刚一个偶然机会发现优酷上竟然有讲解新一代测序技术数据分析的在线视频教程，于是随便点开了几个，看了看。觉得不...

现在的确又不少研究单位和公司开办关于生物信息学、二代测序数据分析等等之类的培训班，说实在这个培训班的效果有多大，确实不好说。但我个人认为，多数这类培训班都是针对生物信息刚入门的学员。因为现在高通量测序...

最近无意中在微软网站下的Microsoft Research上看到看到一项Microsoft Biology Initiative（简称MBI，ybzhao在PLoB这里暂且将其翻译成：“微软生物计划...

MISA，英文全称为MIcroSAtellite identification tool，即微卫星识别工具。虽然前段时间看到PLoB上已经有一篇文章《利用MISA鉴定简单重复序列(SSR)》来介绍MI...

关于Primer3的版权： 使用Primer3大致分为两类人：（1）第一类人为直接使用者，使用Primer3，一定程度上要求引用上述文献；（2）程序员，当将Primer3的源代码加入到你的程序中时，要...