相信Clustal程序是大家耳熟能详的序列比对软件了。其中ClustalX是windows下图形化界面的版本，ClustalW是基于命令行的版本，后者是做生物信息中一般用的比较多，今天的主角就是Clu...

RNA-seq的拼接结果也可以向NCBI提交，第一次提交，还是费了不少事，这里简单总结一下。RNA-seq的拼接结果应该提交到TSA库，TSA全称Transcriptome Shotgun Assem...

什么样的数据，数据制备为什么格式，保存为什么样的形式，GBrowse进行怎样的设置，基因组图谱上就可以展示出来了。 要展示什么样的数据？ 基因组注释数据，比如contig的拼接关系、功能基因的注释、基...

安装步骤 perl、mysql安装略过 apache安装 [shell] % cd httpd-2.x.xx % ./configure --prefix=$HOME/httpd/prefork --...

什么是GBrowse？ The Generic Genome Browser (GBrowse) is a genome viewer. GBrowse是个开源的基因组浏览器； 是一个图形化展示基因组...

最近在biodiscover上发现一个不错的生物信息学分析平台。应该算是一个中文版的Galaxy吧。另外The Pennsylvania State University 也有一个英文版本的Galax...

1.三维分子类 RASMOL：观看生物分子3D微观立体结构 RasTop：为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件 CHIME：直接在浏览器中观看3D分子 MolMol：将pdb等格式的蛋白文件通...

或许你的数据没有发布，你只想部分人员访问你的Gbrowse，这就涉及到了权限管理，GBrowse提供了多种机制，你可以限制访问者的主机、IP地址、域名，或者只有通过用户名密码登陆后才可以访问。 Gbr...

最近一个同学开发了一款很强大的进化树编辑、管理的在线服务程序，EvolView。EvolView是一个进化树可视化的软件，同时可以做各种编辑和处理，同时还支持额外增加一些数据上去，譬如把进化树和其他的...

小型测序仪一般只有台式电脑大小，价格便宜、操作简单，但通量相对较小，一般用于重测序和小基因组或基因组片段的de novo测序 Nicholas Loman在Nature Biotechnology发了...