最近读到一篇Nature Method上一篇关于RNA-seq数据分析的文章，觉得很不错，杜宇刚开始多转录组分析的同学很有帮助，里面还介绍了一些关于可变剪接的问题。 下面列上列上的基本信息： Comp...
比较介绍26种数据挖掘软件
1、数据挖掘软件之ANGOSS软件公司 KnowledgeSTUDIO 平台：NT , Windows 9X 功能：CHAID算法，支持PMML，留有与SAS、S-Plus的接口，能够灵活地导入外部模...
载体屏蔽Crossmatch
简介 Phil Green 和 Brent Ewing 开发的 phrap 软件包的一部分，用于比对两套 DNA 序列，如：可 以用来找出序列中的载体序列，并产生屏蔽了载体的序列；也可以用于 cDNA...
Phd2Fasta
简介 Phd2fasta 是 phred\phrap 软件包的一部分，phred\phrap 软件包由华盛顿大学分子生物技 术学院的 Phil Green 和 Brent Ewing 开发，主要用于学...
DNA测序峰图转化成Phred格式
简介 Phred是 phred\phrap 软件包的一部分，phred\phrap 软件包由华盛顿大学分子生物技术学院的 Phil Green 和 Brent Ewing 开发，主要用于学术科研活动。...
SignalP：信号肽预测工具
SignalP是一个信号肽预测服务器，它的功能是预测给定的氨基酸序列中是否存在潜在的信号肽剪切位点及其所在，原核生物和真核生物都可以进行预测。目前服务器提供的是SignalP 4.0版本。在线服务器网...
外显子组和目标区域深度测序常见问题及解答
1. 测序深度需要达到多少？ 当测序深度为6×时，对目标区域的覆盖度可达90%，深度为20×时，reads对外显子区域的覆盖已接近饱和。此时再提高测序深度，对覆盖度的贡献极小，但是能够增加检测SNPs...
bioinformatics新手指导
“What topics should I study to learn bioinformatics?” – I often get asked this question by biology s...
PrimerX:设计定点突变引物的在线工具
PrimerX 是一款在线工具，用来设计突变PCR引物。PrimerX能够基于两种不同序列数据设计突变引物，一种可以输入突变的DNA序列，另一种是模板DNA编码的蛋白序列，另外还能够鉴定你设计的突变引...
dCAS:Desktop cDNA Annotation System
The Desktop cDNA Annotation System (dCAS) automates large-scale cDNA sequence analysis. dCAS allows ...