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首页20160929
Genomics

三维基因组技术(五):TAD 分析流程

写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.TAD 2.TAD分析流程 2.1 Cworld-dekker软件的安装 git clone https:...
09/292,733评论
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Genomics

三维基因组技术(四):Compartment 分析流程

写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Compartment计算 2.Compartment 分析流程 2.1 Cworld-dekker软件的...
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Genomics

三维基因组技术(三):Hi-C 数据比对及HiC-Pro的使用

1.Hi-C原理简介 1.1 Hi-C技术高通量染色体构象捕获技术(High-throughput chromosome conformation capture)研究全基因组三维构象及分析染色质片段...
09/294,214评论
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Genomics

三维基因组技术(二):Hi-C辅助组装与Lachesis的使用

写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Hi-C 辅助组装(PGA)技术原理 染色质在细胞核内分布的并不是随机分布的,而是不同染色体占据不同的空间...
09/292,426评论
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Genomics

三维基因组技术(一):简单介绍

写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组空间三维结构与功能 染色质空间三维结构 染色体结构 DNA以一长串复杂的线圈形式堆积成染色体。DNA...
09/291,797评论
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Epigenetics

ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤

ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC...
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