碱基平衡性与barcode选择 Bioinformatics

碱基平衡性与barcode选择

碱基平衡性 碱基复杂度与碱基多样性是一个意思;复杂度高,碱基即平衡。低多样性(low diversity)即碱基不平衡,指碱基的组成太单纯了,种类少。碱基复杂度本来无关紧要,从前除了设计PCR的时候考...
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用awk进行简单的编程 Script

用awk进行简单的编程

# 用awk进行简单的编程 # 我们之前已经做过这个了,但是为了让大家我们了解我们正在做什么,我们来再做一遍。 # 提取埃博拉基因组的编码特征、基因以及编码序列。 efetch -db nucleot...
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WGCNA知识点详解 Bioinformatics

WGCNA知识点详解

什么是WGCNA分析? WGCNA分析的全称是加权基因共表达网络分析(Weighted correlation network analysis),是用来描述不同样品之间基因关联模式的生物信息学分析方...
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下载最新版GO Bioinformatics

下载最新版GO

首先要明白,需要下载什么? 要下载四万多条GO记录的详细信息(http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo) 要下载GO与GO之间的关系(http://...
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单细胞测序数据处理知识 Transcriptomics

单细胞测序数据处理知识

简史其实单细胞测序已有十年的历史了,十年来,通量不断提升,成本不断降低,已经到了“旧时王谢堂前燕,飞入寻常百姓家”的历史阶段。不信请看《Nature Methods》2013年度技术;《Nature》...
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NCBI SRA数据库使用详解 Bioinformatics

NCBI SRA数据库使用详解

做为一个合格的生物信息菜鸟,没钱测序咋整,免不了到处求数据呀找数据.....练好基本功必须先从找数据开始!今天小编就来介绍一下一个存储大量高通量数据的的数据库-SRA。 1、简介 SRA(Sequen...
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