Bioinformatics多重假设检验中的p值校正 在生物学特别是基因组学的研究工作中,经常会遇到多重假设检验(multiple testing)的问题;此时,得到的原始p值需要进行校正后才能使用,那么哪种校正方法更加适合自己的研究工作呢?p-valu... 09月03日13,5372FDR 统计 阅读全文
ScriptMATLAB 画图命令总汇 关于颜色说明: r-红色 g-绿色 b-蓝色 c-青色 m-洋红 y-黄色 k-黑色 w-白色 关于形状说明: + 加号 o 圆圈 * 星号 . 点 x 十字 s 矩形 d 菱形 ^ 上三角 v ... 08月31日3,215评论画图 绘图 阅读全文
ScriptMATLAB简单绘图 绘图选项: MATLAB 有许多的绘图选项,以下一一做介绍。如果要将二条曲线划在同一个图,可参考以下的例子: [code lang="matlab"] >> x=linspace(0,2*... 08月31日2,520评论画图 绘图 阅读全文
Scriptmatlab的legend用法 用Matlab画图时,有时候需要对各种图标进行标注,例如,用“+”代表A的运动情况,“*”代表B的运动情况。 legend函数的基本用法是 LEGEND(string1,string2,string3... 08月31日3,992评论参数 画图 阅读全文
Script用R绘画3D饼图 通过使用plotrix包的pie3D命令,可以在R中绘制3D饼图。 [code lang="R"] #载入包 library("plotrix") #数据 pieval <-... 08月30日7,577评论R 画图 阅读全文
Script利用R在一幅图中绘制多个子图 在R中,如何实现在一幅图中绘制多个子图呢,特别是当子图是以群组(group)来归类的时候?下面提供两种解决方案: 先虚构一组数据: [plain] Group Class Num A X 80 A Y... 08月30日7,530评论R 绘图 阅读全文
Script利用Bioperl进行序列输入和输出(Bioperl HOWTO翻译13) 利用BIOPERL进行序列输入和输出 英文原文 注意:由于SyntaxHighlighter的缘故,代码有错误,可能没修改完。 目录 1 作者 2 版权 3 基础 4 十秒速览 5 背景 6 格式 ... 08月01日3,156评论bioperl perl 阅读全文
ScriptBioperl入门其他部分(Bioperl HOWTO翻译12) (译者注:Beginners HOWTO翻译到此结束,从Searching for genes in genomic DNA部分往后都是一些有关bioperl和其他程序接口:调用其他程序并分析结果。专... 08月01日1,573评论bioperl perl 阅读全文
ScriptBioperl快速检索序列(Bioperl HOWTO翻译11) 索引序列文件以用于快速检索 英文原文 索引序列是Bioperl一个非常出色的功能。你可以将需要处理的本地序列文件建立一个索引然后利用这个索引提取你所需要的序列文件。这样做最重要的原因是——速度!从有索... 08月01日1,823评论bioperl perl 阅读全文
Script利用Biperl获取序列基本统计信息(Bioperl HOWTO翻译9) 获取序列基本统计信息 英文原文 除了前面讲的可通过序列对象的不同方法来获取序列文件中已有的序列信息,也可以利用bioperl获取序列的其他一些信息。例如,SeqStats对象可以获取序列的分子质量,单... 07月31日1,942评论bioperl perl 阅读全文