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CIRCOS增加热图、点图、线图和区块属性 Script

CIRCOS增加热图、点图、线图和区块属性

CIRCOS图在有了染色体信息界定绘图区域后,就可以向里面添加离散数据如标记特定的区域或连续数据如展示修饰的丰度等。 经过前面部分对CIRCOS基本安装,最简单绘图和调整各部分属性的熟悉后,这些基本配...
03月05日 3,529 评论
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CIRCOS圈图绘制 – 染色体信息展示和调整 Script

CIRCOS圈图绘制 – 染色体信息展示和调整

CIRCOS圈图绘制 - 最简单绘图和解释介绍了CIRCOS的安装、基本的配置文件的解释、如何最简单的获得一个CIRCOS图。最主要的部分还是配置文件的位置信息和各个参数的含义解释。 本篇则处理染色体...
03月05日 3,772 评论
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CIRCOS圈图绘制 – 最简单绘图和解释 Script

CIRCOS圈图绘制 – 最简单绘图和解释

Circos是绘制圈图的神器,在http://circos.ca/images/页面有很多CIRCOS可视化的示例。 Circos可以在线使用,在线使用时是把表格转为圈图,不过只允许最大75行和75列...
03月05日 8,687 评论
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circos绘图ideogram.conf文件的配置 Bioinformatics

circos绘图ideogram.conf文件的配置

ideogram在基因组绘图中往往表示的就是染色体,在大多数情况下,ideogram是配置文件中重要的部分,也是相对参数较多的circos配置文件。主要内容包括染色体的半径、宽度、颜色,染色体排列方式...
02月19日 2,252 评论
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Circos的安装和简单使用 Bioinformatics

Circos的安装和简单使用

1. Circos简介 Circos用于画基因组圈图。其帮助文档:http://www.circos.ca/documentation/tutorials/ 2. Circos的安装 Circs是pe...
09月21日 20,877 评论
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Circos在windows环境下运行的详细教程 Bioinformatics

Circos在windows环境下运行的详细教程

########################################################### ################### 一、下载安装circos及perl ##...
08月14日 6,307 2
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Circos入门教程 Bioinformatics

Circos入门教程

安装前的一些准备 Config::General File::Basename File::Spec::Functions GD GD::Polyline Getopt::Long IO::File ...
12月18日 19,617 7
阅读全文
Circos:系统生物学里一个画图工具 Bioinformatics

Circos:系统生物学里一个画图工具

Circos是一款非常不错的画图工具,可以广泛用于系统生物学、生物信息学。下面是相关介绍。 Circos is a software package for visualizing data and ...
12月18日 3,943 评论
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