Epigenetics各种染色体元件鉴定方法比较 最近有人问我关于ATAC-Seq与ChIP-Seq的区别。刚好在分析ATAC-Seq和DNase-Seq的数据,于是做了个简单介绍。在六六_ryx的博客里面看到下面的介绍,做了简单修改放在这里跟大家分... 03月01日6,562评论atac-seq chip-seq 阅读全文
Epigenetics一文了解ATAC-seq Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing(ATAC-Seq)即利用转座酶探究可接近性染色质高通... 12月07日26,031评论atac-seq 阅读全文
Epigenetics鉴定可重复的Peaks ATAC-Seq/ChIP-Seq通常需要2个会更多的生物学重复(十分珍贵或者稀有样本除外,但必须做至少2次技术重复)。理论上重复样本的peaks应该有高度的一致性,实际情况并不完全与预期一致。如何评... 10月01日4,710评论atac-seq chip-seq 阅读全文
EpigeneticsATAC-Seq分析教程:ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析 ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC... 09月29日2,749评论atac-seq 阅读全文
EpigeneticsATAC-Seq分析教程:差异peaks分析——DiffBind ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC... 09月29日6,747评论atac-seq 阅读全文
EpigeneticsATAC-Seq分析教程:用ChIPseeker对peaks进行注释和可视化 ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC... 09月29日4,856评论atac-seq ChIPseeker 阅读全文
EpigeneticsATAC-Seq分析教程:重复样本的处理-IDR ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC... 09月29日3,940评论atac-seq IDR 阅读全文
EpigeneticsATAC-Seq分析教程:对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估(二)ChIPQC ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC... 09月29日1,595评论atac-seq 质量评估 阅读全文
EpigeneticsATAC-Seq分析教程:用MACS2软件call peaks ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC... 09月29日5,716评论atac-seq MACS2 阅读全文
EpigeneticsATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq简介 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是201... 04月29日1,655评论atac-seq 阅读全文