Epigenetics评估测序文库复杂度 Library Complexity 在制备测序文库时,经常会增加PCR的步骤来扩增DNA片段。如何评估PCR的效果和影响,本文主要分享ENCODE中针对ChIP-Seq和ATAC-Seq标准来说明。 ENCODE中主要通过三个参数来反应... 04月04日5,9761 chip-seq 测序 阅读全文
Bioinformatics搞懂illumina nextera Tn5 和ATAC seq adaptor 序列 在准备NGS文库的时候,会有用到转座酶Tn5,Nextera DNA Library Preparation Kit ,比如ATAC-seq就有用到这个Tn5。转座酶携带有特定的序列称为转座子Tran... 02月25日19,0621 atac-seq 阅读全文
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EpigeneticsATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析 一、基础知识 1. 解密表观遗传学的三个方向与测序方法 1. 探索染色质的开放性(chromatin accessibility) ATAC-seq: Assay of Transposase Acc... 09月29日12,583评论atac-seq 阅读全文