Bioinformatics

碱基平衡性与barcode选择

碱基平衡性 碱基复杂度与碱基多样性是一个意思;复杂度高,碱基即平衡。低多样性(low diversity)即碱基不平衡,指碱基的组成太单纯了,种类少。碱基复杂度本来无关紧要,从前除了设计PCR的时候考...
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Bioinformatics

二代测序的barcode/index

二代测序二代测序是做什么的 如何选择好的barcode barcode组合举例 建库测序时barcode是如何发挥作用的 barcode,也叫index,在二代测序里面是用于区分不同样品的。为了避免概...
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Bioinformatics

二代测序的Barcode选择

1 混合样本测序 现代测序仪的生产能力正在经历突飞猛进的提高,数据量远远大于单个样本测序所需,因此在很多情况下,需要把多个样本混合在一起测序,以充分发挥仪器的能力,节约测序成本。像外显子组测序、转录组...
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Glossary

二代测序中barcodes index的介绍

刚接触高通量测序的同学,可能会接触到barcode index等名词。 为什么要有barcodes ? 原因很简单,一个lane有效数据30来G 我们并常常不可能拿一个样品测那么大数据量,尤其是RNA...
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