ScriptSeaborn 和 Matplotlib 数据可视化 简述 Python 中,数据可视化一般是通过较底层的 Matplotlib 库和较高层的 Seaborn 库实现的,本文主要介绍一些常用的图的绘制方法。在正式开始之前需要导入以下包 import nu... 01月31日2,840评论python seaborn 阅读全文
ScriptRIdeogram:画染色体图 由小丫画图开始并推动,产生了一个CRAN包——RIdeogram 今天已由CRAN审核通过,一行命令搞定安装: install.packages("RIdeogram") 【需求描述】 我要画差异表达... 01月27日15,317评论Ideogram 染色体图 阅读全文
ScriptConda工具使用 1. 介绍 任何语言的包,依赖和环境管理:Python,R,Ruby,Lua,Scala,Java,Javascript,C / C ++,FORTRAN Conda是一个开源包管理系统和环境管理系统... 01月22日2,839评论Conda python 阅读全文
ScriptR语言学习 – 入门环境Rstudio安装 R语言是比较常用的统计分析和绘图语言,拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库,是学习生物信息分析的必备语言之一。 Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一,支持纯R... 01月14日2,173评论R RStudio 阅读全文
ScriptConda常用命令 Conda 环境 # 创建一个名为python34的环境,指定Python版本是3.4 conda create --name python34 python=3.4 # 激活某个环境 activat... 01月04日1,714评论 阅读全文
ScriptR中坐标轴截断的不同实现方式 本文在做学术论文中,正好想做一下把y轴一些数据进行截断的效果。通过网上检索,整理了一下两种方式构建坐标轴截断图。 plotrix包 利用gap.barplot()进进行绘制,将gap参数设置为90,4... 01月01日2,665评论坐标轴截断 阅读全文
Script基于R语言绘制坐标轴截断图 画图时经常遇到不同组的数据大小相差很大,大数据就会掩盖小数据的变化规律,这时候可以对Y轴进行截断,从而可以在不同层面(大数据和小数据层面)全面反映数据变化情况,如下图所示。 搜索截断图绘制的方法,有根... 01月01日3,511评论R 截断坐标轴 阅读全文
ScriptCONDA使用入门 近来已经习惯使用 Continuum Analytics 公司的Conda产品作为我的主要开发工具箱. Conda提供比隔离环境包 virtualenv 和 python 版本切换包 p... 12月29日2,547评论 阅读全文
ScriptK-means算法通俗原理及Python与R语言的分别实现 K均值聚类方法是一种划分聚类方法,它是将数据分成互不相交的K类。K均值法先指定聚类数,目标是使每个数据到数据点所属聚类中心的总距离变异平方和最小,规定聚类中心时则是以该类数据点的平均值作为聚类中心。 ... 12月20日3,177评论python 聚类 阅读全文
ScriptR语言标记显著性标记 学术论文和杂志中最常见的是用“字母”和“星号”标记差异显著性,在之前的文章《显著性分析后如何标记“abc”?》已经介绍过如何用SPSS比较均值的结果进行“纯手动”添加字母显著性标记。嗯,方法似乎非常“... 11月10日12,732评论R 显著性分析 阅读全文