如何利用BioJava构建一个FASTA解析器解析FASTA搜索结果

  • A+
所属分类:Script

前面介绍了《如何利用BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果》,解析FASTA结果和解析Blast结果非常相似。

仅仅将解析Blast结果的程序中的:


XMLReader parser = new BlastLikeSAXParser();

替换成:


XMLReader parser = new FastaSearchSAXParser();

即可。

avatar

发表评论

:?: :razz: :sad: :evil: :!: :smile: :oops: :grin: :eek: :shock: :???: :cool: :lol: :mad: :twisted: :roll: :wink: :idea: :arrow: :neutral: :cry: :mrgreen: