如何利用BioJava构建一个FASTA解析器解析FASTA搜索结果

评论1,251

前面介绍了《如何利用BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果》,解析FASTA结果和解析Blast结果非常相似。

仅仅将解析Blast结果的程序中的:

[code lang="java"]
XMLReader parser = new BlastLikeSAXParser();
[/code]

替换成:

[code lang="java"]
XMLReader parser = new FastaSearchSAXParser();
[/code]

即可。

发表评论

匿名网友