前面介绍了《如何利用BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果》,解析FASTA结果和解析Blast结果非常相似。
仅仅将解析Blast结果的程序中的:
XMLReader parser = new BlastLikeSAXParser();
替换成:
XMLReader parser = new FastaSearchSAXParser();
即可。
前面介绍了《如何利用BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果》,解析FASTA结果和解析Blast结果非常相似。
仅仅将解析Blast结果的程序中的:
XMLReader parser = new BlastLikeSAXParser();
替换成:
XMLReader parser = new FastaSearchSAXParser();
即可。