R语言学习 - 热图绘制 (heatmap) Script

R语言学习 – 热图绘制 (heatmap)

热图绘制 热图是做分析时常用的展示方式,简单、直观、清晰。可以用来显示基因在不同样品中表达的高低、表观修饰水平的高低等。任何一个数值矩阵都可以通过合适的方式用热图展示。 本篇使用R的ggplot2包实...
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R语言学习 - 入门环境Rstudio Script

R语言学习 – 入门环境Rstudio

R语言是比较常用的统计分析和绘图语言,拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库,是学习生物信息分析的必备语言之一。 Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一,支持纯R...
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HDF5 使用介绍 Script

HDF5 使用介绍

1、HDF5介绍 HDF 是用于存储和分发科学数据的一种自我描述、多对象文件格式。HDF 是由美国国家超级计算应用中心(NCSA)创建的,以满足不同群体的科学家在不同工程项目领域之需要。HDF 可以表...
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杂志图表的经典用色 Script

杂志图表的经典用色

《经济学人》常用的藏青色 经济学人上的图表,基本只用这一个颜色,或加上一些深浅明暗变化,再就是左上角的小红块,成为经济学人图表的招牌样式。罗兰贝格也非常爱用这个色,有时也配合橙色使用。各类提供专业服务...
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R绘图基础(10)热图 heatmap Script

R绘图基础(10)热图 heatmap

我们在分析了差异表达数据之后,经常要生成一种直观图--热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例,示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...
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