FASTX-Toolkit Bioinformatics

FASTX-Toolkit

FASTX-Toolkit是一款用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序,里面包含了丰富的FASTA/FASTQ文件格式转换、统计等命令。 下面是其功能介绍:  FASTQ-t...
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得分矩阵PAM与BLOSUM的比较与区别 Bioinformatics

得分矩阵PAM与BLOSUM的比较与区别

对于蛋白质序列,计分矩阵主要用于记录在做序列比对时两个相对应的残基的相似度,一旦这个矩阵定义好了以后,比对程式就可以利用这个矩阵,尽量将相似的残基排在一起,以达到最好的比对。 得分矩阵主要有两种,第一...
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测序峰图的基本知识 Bioinformatics

测序峰图的基本知识

  测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件,峰图文件为Abi格式,用chromas软件(网上可下载)打开. 四种颜色的波形代表四种碱基的信号强度; 正常的峰图,波峰与波谷清晰...
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