WES(3)snp-filter Genomics

WES(3)snp-filter

其中freebayes,bcftools,gatk都是把所有的snp细节都call出来了,可以看到下面这些软件的结果有的高达一百多万个snp,而一般文献都说外显子组测序可鉴定约8万个变异! 这样得到突...
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WES(2)snp-calling Genomics

WES(2)snp-calling

准备文件:下载必备的软件和参考基因组数据 1、软件 ps:还有samtools,freebayes和varscan软件,我以前下载过,这次就没有再弄了,但是下面会用到 2、参考基因组 3、参考 突变数...
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WES(1)测序质量控制 Genomics

WES(1)测序质量控制

这一步主要看看这些外显子测序数据的测序质量如何: 首先用fastqc处理,会出一些图表,肯定是没问题的啦,如果数据有问题,公司就不会给你,那样不砸了他们自己的招牌嘛。 然后我们粗略统计下平均测序深度及...
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江苏无锡易欧生物诚聘英才! Advertisement

江苏无锡易欧生物诚聘英才!

一、招聘岗位:英文编辑 工作地点: 无锡 岗位职责: 1)按SCI论文发表要求,对中文/英论文进行修改; 2)在规定时间内完成高质量的修改任务; 3)撰写英文科研报告。 任职要求: 1)生物、医学、农...
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color space的测序数据 Bioinformatics

color space的测序数据

看了illumina的测序仪市场份额的确很夸张,像我这样在生信数据分析领域身经百战的老鸟,都是直到今天才碰到color space的测序数据。测序平台是AB 5500xl Genetic Analyz...
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