基因数据库下载

下面是Ensembl上的基因数据库下载,主要是哺乳动物,包括基因组序列,核酸序列,蛋白序列,及这些序列在EMBL和NCBI上的注释,还有提供的MYSQL数据库文件,并对物种名称做了一下简单的翻译,方便查找。如果要查找更详细的情况,可以直接上EMBL的网站。

TranslateSpeciesDNAcDNAncRNAProtein sequenceAnnotated sequence (EMBL)Annotated sequence (GenBank)Gene sets
Human
Homo sapiens
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小鼠Mouse
Mus musculus
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斑马鱼Zebrafish
Danio rerio
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羊驼Alpaca
Vicugna pacos
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变色龙Anole lizard
Anolis carolinensis
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穿山甲Armadillo
Dasypus novemcinctus
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丛猴Bushbaby
Otolemur garnettii
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玻璃海鞘C.intestinalis
Ciona intestinalis
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萨氏海鞘C.savignyi
Ciona savignyi
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线虫Caenorhabditis elegans
Caenorhabditis elegans
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Cat
Felis catus
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Chicken
Gallus gallus
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黑猩猩Chimpanzee
Pan troglodytes
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中国鳖Chinese softshell turtle
Pelodiscus sinensis
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鳕鱼Cod
Gadus morhua
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腔棘鱼Coelacanth
Latimeria chalumnae
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奶牛Cow
Bos taurus
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Dog
Canis lupus familiaris
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海豚Dolphin
Tursiops truncatus
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Elephant
Loxodonta africana
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雪貂Ferret
Mustela putorius furo
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果蝇Fruitfly
Drosophila melanogaster
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河豚Fugu
Takifugu rubripes
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长臂猿Gibbon
Nomascus leucogenys
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大猩猩Gorilla
Gorilla gorilla gorilla
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豚鼠Guinea Pig
Cavia porcellus
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刺猬Hedgehog
Erinaceus europaeus
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Horse
Equus caballus
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蹄兔Hyrax
Procavia capensis
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长鼻袋鼠Kangaroo rat
Dipodomys ordii
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七鳃鳗Lamprey
Petromyzon marinus
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小刺猬猬Lesser hedgehog tenrec
Echinops telfairi
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猕猴Macaque
Macaca mulatta
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狨猴Marmoset
Callithrix jacchus
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青鳉Medaka
Oryzias latipes
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狐蝠科Megabat
Pteropus vampyrus
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蝙蝠Microbat
Myotis lucifugus
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鼠狐猴Mouse Lemur
Microcebus murinus
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负鼠Opossum
Monodelphis domestica
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猩猩Orangutan
Pongo abelii
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熊猫Panda
Ailuropoda melanoleuca
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Pig
Sus scrofa
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鼠兔Pika
Ochotona princeps
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剑尾鱼Platyfish
Xiphophorus maculatus
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鸭嘴兽Platypus
Ornithorhynchus anatinus
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Rabbit
Oryctolagus cuniculus
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大鼠Rat
Rattus norvegicus
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酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
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鼩鼱Shrew
Sorex araneus
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树懒Sloth
Choloepus hoffmanni
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松鼠Squirrel
Ictidomys tridecemlineatus
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棘鱼Stickleback
Gasterosteus aculeatus
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眼镜猴Tarsier
Tarsius syrichta
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袋獾Tasmanian devil
Sarcophilus harrisii
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Tetraodon
Tetraodon nigroviridis
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罗非鱼Tilapia
Oreochromis niloticus
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树鼩Tree Shrew
Tupaia belangeri
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火鸡Turkey
Meleagris gallopavo
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袋鼠Wallaby
Macropus eugenii
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非洲爪蟾蜍Xenopus
Xenopus tropicalis
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斑胸草雀Zebra Finch
Taeniopygia guttata
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原文来自:http://bioinformation.cn/?p=279

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