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ggplot2作图详解7:主题(theme)设置

凡是和数据无关的图形设置内容理论上都可以归 主题类 但考虑到一些内容(如 坐标轴 )的特殊性,可以允许例外的情况。主题的设置相当繁琐,很容易就占用了大量的作图时间,应尽量把这些东西简化,把注意力主要放...
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ggplot2作图详解6:标尺(scale)设置

标尺是ggplot2作图必需的元素,在《映射》一节提到了它的概念并简单进行了设置。在数据分析阶段,为避免陷入数据无关的垃圾坑,我们只需要设置映射,ggplot2自动配置合适的标尺并产生坐标和图例。这是...
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ggplot2作图详解4:分面(faceting)

“facet”一词这里翻译为“分面”,不知道是否准确,可以斟酌。虽然我们前面说过ggplot2分面最终的效果是一页多图,但跟通常所说的在“一个页面中绘制多个图形”还是有区别的。ggplot2仅仅体现的...
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ggplot2作图详解3:映射(mapping)

作图前的数据准备工作不仅仅指原始数据的收集,还包括数据外观的整理,这些工作对后续的作图无疑十分重要。和其他作图方法相比,ggplot2的优点之一就是把数据整理融合到了作图过程中,替用户分担了数据整型的...
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ggplot2作图详解2:ggplot图形对象

前面我们使用qplot函数对ggplot2做图的方法进行了初步的了解,并比较了qplot和plot函数的用法。从最终得到的结果(图形)来看,除了外观不同外好像qplot函数和plot函数并没有什么本质...
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Evolution

利用phylip构建进化树详解

构建进化树可以用DNA序列,也可以用protein序列。本文就如何利用蛋白序列进行进化树的构建步骤进行详细解析: 一、利用phylip进行蛋白序列进化树分析步骤 1. 运行Clustalw,得到pro...
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