Glossary

内含子有什么用?

作者:牛登科 三十年前问这个问题?你得到的答复是内含子没什么用,属于垃圾DNA或者说分子水平的寄生虫。 但是后来,一个又一个基因的可变剪接现象被发现。尤其是人类基因组测序完成后,人类基因组中没有发现原...
阅读全文
Glossary

操纵子有什么用?

作者:牛登科 学过生物学的人可能都知道乳糖操纵子。在大肠杆菌基因组中,乳糖分解、运输的三个基因连在一起,由前端共同的Promoter区域调节三个基因的表达。这三个基因,就像俗话中一根绳上的蚂蚱。操纵子...
阅读全文
Genomics

宏基因组学中微生物种群结构分析

什么叫宏基因组学?先做一个概念的普及,下面是摘取自百度百科的几段介绍: 宏基因组学又叫微生物环境基因组学、元基因组学,Metagenomics 宏基因组学通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构...
阅读全文
Transcriptomics

差异表达基因的分析(2)

应学生及个别博友的要求,尽管专业博文点击率和反应均很差,但在去San Diego参加PAG会议之前,还是抽时间给出【R高级教程】的第二专题。专题一给出了聚类分析的示例,本专题主要谈在表达谱芯片分析中如...
阅读全文
Transcriptomics

表达谱芯片的聚类分析

【在国际上,R软件的应用是数据分析的主流发展趋势之一,但我发现在国内R软件的使用远不如SPSS、SAS等软件那么流行。为推广R软件的使用,本博客将陆续推出“R高级教程”系列专辑,希望对生命科学领域的科...
阅读全文
Advance

最新研究质疑RNA测序数据的统计分析

过去几年间,高通量RNA测序已经取得了一些意想不到的成果,其中一些似乎是能够改写传统遗传学智慧的突破性发现。但是,这些调查结果现在受到了挑战,计算生物学家警告说,在这些数据密集型研究(data-int...
阅读全文
Script

生物信息画图颜色搭配以及颜色卡

最近在用Qt写一个可视化软件,需要预先设定一些颜色搭配。刚好在网上收到了两张不错的颜色搭配图,与大家分享一下。大家在用R、matlab等画图的时候可以参考一下。 颜色搭配图: 各种颜色对应的名称与RB...
阅读全文
Popular Science

与细菌共生

撰文╱阿克曼(Jennifer Ackerman)翻譯╱涂可欣 重点提要 人体内的细菌细胞数是人类细胞的10倍,然而研究人员直到最近,才开始了解微生物对健康的帮助。 有些细菌会制造人体无法合成的有益化...
阅读全文