高度重复序列简介 Glossary

高度重复序列简介

高度重复序列在基因组中重复频率高,可达百万(106)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。 (1)倒位(反...
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mpiBlast的安装和使用 Bioinformatics

mpiBlast的安装和使用

之前一直在用NCBI新的blast+,速度不错。但是blast的线程是内存空享的,即只能单节点运算。手头能使用的计算资源只能达到单节点16 threads。动辄上万条的对比实在是太慢了。遂萌生用mpi...
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