高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变...
基因组拼接中常见的名词解释
Read：高通量测序平台产生的序列就称为reads。 Contig：拼接软件基于reads之间的overlap区，拼接获得的序列称为Contig（重叠群）。 Scaffold：基因组de novo测序...
在de Bruijn Graphs中利用mate pair的信息
This is the last post in the de Bruijn graph series. Although we did not mention explicitly, each of...
bioinformatics新手指导
“What topics should I study to learn bioinformatics?” – I often get asked this question by biology s...
Velvet的exp_cov参数介绍
Appropriate choice of the ‘exp_cov’ (expected coverage) parameter in Velvet is very important to get...
用matlab画boxplot中的一些应用说明
由于matlab具有强大的计算功能，用其统计数据功能优点显而易见，这里分享使用matlab中的boxplot的一些技巧，供大家参考。 Matlab boxplot命令 格式如下 boxplot(X)：...
PrimerX:设计定点突变引物的在线工具
PrimerX 是一款在线工具，用来设计突变PCR引物。PrimerX能够基于两种不同序列数据设计突变引物，一种可以输入突变的DNA序列，另一种是模板DNA编码的蛋白序列，另外还能够鉴定你设计的突变引...
dCAS:Desktop cDNA Annotation System
The Desktop cDNA Annotation System (dCAS) automates large-scale cDNA sequence analysis. dCAS allows ...
常用Motif预测软件
ELPH is a general-purpose Gibbs sampler for finding motifs in a set of DNA or protein sequences. The...
Tablet:Next Generation Sequence Assembly Visualization
Tablet is a lightweight, high-performance graphical viewer for next generation sequence assemblies a...