StatisticsSPSS学习笔记之——两独立样本的非参数检验(Mann-Whitney U 秩和检验) 一、概述 Mann-Whitney U 检验是用得最广泛的两独立样本秩和检验方法。简单的说,该检验是与独立样本t检验相对应的方法,当正态分布、方差齐性等不能达到t检验的要求时,可以使用该检验。其假设基... 03月09日 2,708 评论 阅读全文
StatisticsSPSS学习笔记之——两配对样本的非参数检验(Wilcoxon符号秩检验) 一、概述 非参数检验对于总体分布没有要求,因而使用范围更广泛。对于两配对样本的非参数检验,首选Wilcoxon符号秩检验。它与配对样本t检验相对应。 二、问题 为了研究某放松方法(如听音乐)对于入睡时... 03月09日 11,068 评论 阅读全文
StatisticsSPSS学习笔记之——OR值与RR值 在临床研究中,常常有OR、RR值,表示某因素对病情的影响程度。 下面学习一下Odds、OR、RR的概念: 在病例对照研究中,可以画出下列的四格表: -------------------------... 03月09日 5,757 评论 阅读全文
BioinformaticsSPSS学习笔记之——二项Logistic回归分析 一、 概述 Logistic回归主要用于因变量为分类变量(如疾病的缓解、不缓解,评比中的好、中、差等)的回归分析,自变量可以为分类变量,也可以为连续变量。他可以从多个自变量中选出对因变量有影响的自变量... 03月09日 3,145 评论 阅读全文
Advance从宏基因组数据中分离出单个物种基因组序列 从由细菌、古细菌和病毒组装的错综复杂宏基因组DNA序列中,研究人员获得一种神秘的广古菌的整个基因组序列。 宏基因组学(metagenomics,译者注:也常译作环境基因组学)就是取样---一勺泥土或一... 03月04日 1,233 评论 阅读全文
ScriptLinux crontab 命令格式与详细例子 基本格式 : * * * * * command 分 时 日 月 周 命令 第1列表示分钟1~59 每分钟用*或者 */1表示 第2列表示小时1~23(0表示0点) 第3列表示日期1~31 ... 03月04日 113 评论 阅读全文
Bioinformaticsperl文件的读写 一、打开、关闭文件 语法为open (filevar, filename),其中filevar为文件句柄,或者说是程序中用来代表某文件的代号,filename为文件名,其路径可为相对路径,亦可为绝对路... 03月03日 3,735 评论 阅读全文
Scriptperl内置变量 大家先看一个例子: #!/usr/bin/perl use warnings; @array = qw(a b c d); foreach (@array) { print $_,”\n”; } 例子... 03月03日 441 评论 阅读全文
GenomicsN50多少,证明组装的好 1、简介 大家在科研和工作过程中,经常会接触到n50,n90,这些概念。比如从头组装一个基因组,n50应该达到多少,才算合适呢。当然现在情况下,接触牛叉的测序新技术,是越长越好, 但是对于那些不好组装... 03月01日 446 评论 阅读全文
Statistics因变量有序多分类资料的logistic回归:SPSS操作与回归系数的解释 有序多分类的logistic回归在spss操作上并不难,难的是对回归系数的解释。诸多教程上将OR(即exp(β))解释为“固定其他因素的影响,自变量每改变一个单位,因变量提高至少一个(一个及一个以上)... 03月01日 1,783 评论 阅读全文