这个软件（也有在线服务器，见其官网http://www.bioinformatics.org/cd-hit/）是中国人（Weizhong Li）写的，很好用，最大的特点就是快。基本思路是首先对所有序列...

The format for GenBank Accession numbers are: GenBank Accession numbers命名的规则是: Nucleotide: 1 letter ...

NCBI RefSeq (美国国立生物技术信息中心参考序列库) 是目前世界上最具有权威性的序列数据库。NCBI的参考序列计划（RefSeq）将为中心法则中自然存在的分子，从染色体到mRNA到蛋白提供参...

有时,在推断进化树的过程中,我们希望phylip格式的文件能够将序列的名称完整得保留下来。通常情况下,我们的名称会超过10字符, 而ClustalX和MUSCLE等软件给出的phylip文件是严格的p...

GI number及Accession.Version就像是序列的身份证号码一样。通过这个号码，我们能在NCBI/DDBJ/EMBL等数据库查到该序列的数据。 问题： 为什么会有两种类型的序列标识符（...

GenBank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。每个记录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段。这些文件按类别分为几组：有些按照系统发...

1. $_ $ARG，常常是一个默认变量   2. @_ @ARG，子例程参数表   3. {row.content} $PROGRAM_NAME，本程序的名字   4....

在以往R语言的教材、帮助示例和各类读书笔记中，有关图形中标注公式的介绍只有指定符号和数字的介绍。如何像SPSS那样在计算结束后将带参数的模型计算公式一并绘制在图形中呢？其实提取模型参数很简单，关键是如...

在做生物信息数据挖掘、分析之后为了可视化，我们常常需要画各种图。这里给大家推荐一个很不错的网站。http://addictedtor.free.fr/graphiques/ 这个网站里面包含了大量的利...

目前有不少用于基因组装配和比对的程序和算法，但是该选哪一个呢？许多序列分析的专家认为，这取决于基因组的大小、读取有多长，以及采用的是哪种测序技术。通常，软件还需要优化，以满足每个实验室的独特需求。在此...