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如何利用BioJava构建一个FASTA解析器解析FASTA搜索结果

前面介绍了《如何利用BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果》,解析FASTA结果和解析Blast结果非常相似。 仅仅将解析Blast结果的程序中的: [code lang="java...
09/161,735评论
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Script

如何利用BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果

一个生物信息学常遇到的任务是BLAST搜索。Biojava能够解析哪些"BLAST"类型的输出,比如Blast或者HMMER的输出。Biojava在这里使用了基于SAX事件处理的方法,通过设置监听器来...
09/162,126评论
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Script

利用BioJava定制一个点位置(PointLocaiton)

在Biojava中,序列中的位置是用一个实现了位置(Location)接口的简单对象代表的。 一个点位置是序列或者标志链(SymbolList)中单个标志(Symbol)的位置.点位置有公共的构造器可...
09/161,657评论
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