Python语言培训(零基础初级班)

Python是一种解释型、面向对象、动态数据类型的高级程序设计语言。由于Python语言的简洁、易读以及可扩展性,在国内外用Python做科学计算的研究机构日益增多,在生物信息学和医学领域已经有大量程序软件全部或部分使用Python来设计。Python的使用率呈线性增长,已经成为最受欢迎的程序设计语言之一。Python目前拥有很多专用的科学计算扩展库,例如十分经典的科学计算扩展库NumPy、SciPy和生物信息学专用的Biopython,它们分别为Python提供了快速数组处理、数值运算以及绘图功能,还有专门的生物信息学处理分析功能。因此Python语言十分适合工程技术、科研人员处理实验数据、制作图表,甚至开发科学计算应用程序。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员开展了此培训,帮助大家快速开展生物信息数据各项分析。欢迎您报名参加!

主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部

举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间:2014.6.21-6.24日

培训内容及安排:

日期时间授课题目授课内容
第一天09:30-10:30Python概述及其在生物信息领域的应用概括介绍Python语言的概念及特点,及其在生物信息领域的应用
10:30-12:00Python软件安装、运行与基本操作Python及iPython的安装及使用,Python程序的运行;DOS、Unix命令行操作基本命令;Python变量定义、数字及基本运算
13:30-15:00核心数据类型(1)列表、元组
13:30-16:00基本语法结构判断结构、循环结构、异常处理
16:00-17:00实例练习使用python编程,生成斐波那契数字序列
第二天09:30-11:00核心数据类型(2)字符串、字典
11:00-13:00文件与文件夹操作文件的读入与写入、文件夹操作
13:30-17:00实例练习FASTA文件的处理:1、序列基本信息的统计;2、序列反转和切割
第三天09:30-11:00函数和模块系统库函数、第三方函数、自定义函数;模块定义、导入、使用
11:00-12:00正则表达式Python特色功能正则表达式学习与应用
13:30-14:30实例练习系统命令在python中的调用
14:30-17:00实例练习大数据文件的分割及合并
第四天09:30-11:00BioPython简介及应用实例BioPython安装及学习,生物信息学中的实际应用
11:00-12:00BioPython快速应用使用BioPython处理传统的生物信息数据
15:00-17:00实例练习应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。应用biopython在blast xml结果文件中提取目的信息。
授课实例
  1. 大数据文件分割。
  2. 系统命令在python程序中的调用。
  3. fasta文件中序列基本信息统计:序列数、碱基数、及平均长度。
  4. 生物信息学二代测序数据质量控制及预处理。(选学)
  5. fasta序列反向互补转换。
  6. 应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。
  7. 应用biopython在blast xml结果文件中提取目的信息。
  8. 多样品混合测序,根据标签序列barcode对原始测序数据进行分样。(选学)

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)

培训特色

1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;

3、功能强大、跨平台;4、灵活易用

报名费用  注册费:3200元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)

报名优惠政策

1、2014年5月15日前报名,可优惠200元。

2、2人团报每人可减免200元,3人以上团体报名每人可减少400元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额

4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

注意事项

1、        已经成功付款的学员,如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。

2、        撤销席位后,学员可提交延期申请,可参加当前时间到2014.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担

联系咨询

张老师 010-59341771 ,18618295767,QQ号:2814500767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn

员老师 010-59341773, 18701529461 ,  邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

网址:http://bioc.bcc.ac.cn/China/

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