人类医学数据关联分析精品班

以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设人类医学数据关联分析精品班

为了确保教学质量,授课团队由具有8年以上统计学、遗传学、人类医学及计算科学研究经验的老师领衔,曾成功申请、主持或参与国内外多项重大课题,具有丰富的论文写作、发表经验,小班人数限15-20人,1-3天课程可选修,额满为止,预报从速!

主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部

举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间2014年6月25-28日

培训内容及安排

日期 授课题目 授课内容
第一天 概率论和统计学理论基础 1、经典概率论及其统计2、贝叶斯概率及其统计
R语言统计分析 3、R语言基础4、使用R语言进行基础统计学分析
第二天 连锁分析和关联分析理论基础 5、连锁分析的原理及常用软件6、候选基因关联分析的原理及常用软件

7、全基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件:基于芯片的GWAS,基于NGS的GWAS

常用连锁、关联软件实习 8、MERLIN9、Plink

10、Haploview等

第三天 基于NGS的GWAS实用策略 11、转录组/外显子组测序原理12、低覆盖度测序+基因型填充原理

13、Linux常用命令

基于NGS的GWAS上机 14、转录组/外显子组/基因组重测序数据分析15、SNP分型及基因型获得

16、缺失基因型填充

17、NGS-GWAS

18、IGV可视化

19、ANNOVAR功能注释

第四天 分子动力学基础 20 分子模拟的计算原理21 分子力场的概述

22 分子动力计算的应用

常用分子动力学相关软件的使用 23 Gromacs24 VMD

25 Pymol

(课程内容以实际授课为准)

培训特色

无需任何计算机语言基础

深入简出,内容精要实用

结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授

统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用

边学边练,重实践,力求实效

小班授课,个别辅导

报名费用  注册费:4000元/人,主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)

报名优惠政策

1、2014年6月1日前报名,可享受减免300元优惠。

2、2人团报每人可减免200元,3人以上团体报名每人可减少400元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额

4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

联系咨询

张老师 010-59341771,18618295767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn QQ:2814500767

员老师  010-59341773,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

网址:http://bioc.bcc.ac.cn/China/

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