NCBI的数据库介绍 Glossary

NCBI的数据库介绍

GenBank Overview 基本信息 什么是GenBank?GenBank是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。Ge...
阅读全文
关于RefSeq:NCBI参考序列 Bioinformatics

关于RefSeq:NCBI参考序列

NCBI的参考序列计划(RefSeq)将为中心法则中自然存在的分子,从染色体到mRNA到蛋白提供参考序列标准。RefSeq标准为人类基因组的功能注解提供一个基础。它们为突变分析,基因表达研究,和多态发...
阅读全文
BLAST+的使用 Bioinformatics

BLAST+的使用

BLAST+与BLAST相比,有很多改进和提高,NCBI强烈推荐放弃BLAST,使用BLAST+, 这里说的BLAST和BLAST+,都是本地的。BLAST下载地址:NCBI BLAST+ (ftp:...
阅读全文
NCBI RefSeq命名格式的详细说明 Glossary

NCBI RefSeq命名格式的详细说明

NCBI RefSeq (美国国立生物技术信息中心参考序列库) 是目前世界上最具有权威性的序列数据库。NCBI的参考序列计划(RefSeq)将为中心法则中自然存在的分子,从染色体到mRNA到蛋白提供参...
阅读全文
GenBank数据库格式的说明 Glossary

GenBank数据库格式的说明

GenBank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库,汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。每个记录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段。这些文件按类别分为几组:有些按照系统发...
阅读全文
Gene Expression Omnibus (GEO)介绍 Glossary

Gene Expression Omnibus (GEO)介绍

为了支持公共使用和散布基因表达数据,NCBI开始了基因表达汇编(GEO)计划。GEO是努力建立一个基因表达数据仓库和在线资源,用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。来自于microarray,高...
阅读全文