Bioinformatics

详解motif的PFM矩阵

在之前的文章中,对motif的几个基本概念进行了简单介绍。一致性序列采用IUPAC碱基表示标准来描述motif的序列信息,sequence logo是结合碱基分布频率和一致性序列的一种直观展示形式。本...
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Genomics

DNA motif 搜索算法总结

DNA功能域(motif)简单地讲就是一段特定模式的DNA序列,它之所以可以具有生物学功能是因为它的特殊序列可以和调控蛋白结合,比如转录因子,从而可以在短暂时间内锚定功能蛋白。通常,DNA功能域的长度...
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