在做生物信息数据分析中，R的使用是非常普遍。利用R来做数据处理和画图几乎是家常便饭。这里跟大家分享各种R package使用手册的简要版手卡，其中包括ggplot画图、R中数据操作、机器学习等等。下面...
R语言画图、数据分析、机器学习快速参考手册
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用ggrepel包画图标记不重叠标签
当我们在图形中添加标签时，标签之间很容易相互重叠，包ggrepel就专门用来解决这个问题！ 首先我们来看看通过geom_text()添加标签时的情形： library(ggplot2) #使用数据集m...
利用ggpubr包进行R语言可视化
Hadley Wickham创建的可视化包ggplot2可以流畅地进行优美的可视化，但是如果要通过ggplot2定制一套图形，尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形，对于那些没有深入了解ggplot2的人...
利用ggplot2从0开始绘制PCA图
PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一种使用最广泛的数据降维算法。在数据分析以及生信分析中会经常用到。 本文利用R语言的ggplot2包，从头带您绘...
R绘图基础（10）热图 heatmap
我们在分析了差异表达数据之后，经常要生成一种直观图－－热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例，示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...
ggplot2入门与进阶
ggplot2包是基于Wilkinson在《Grammar of Graphics》一书中所提出的图形语法的具体实现, 这套图形语法把绘图过程归纳为data, transformation, scal...
如何使用 ggplot2
作者：黄宝臣 链接：https://www.zhihu.com/question/24779017/answer/38750383 来源：知乎 著作权归作者所有，转载请联系作者获得授权。 总结来说有以...
ggplot2 – 二维数据密度图
地理课上，我们经常会看到等高线。在ggplot2中，也有实现一个和等高线差不多的利器 stat_density2d() 看个例子先 # The base plot p <- ggplot(fai...
利用ggplot2画出各种漂亮图片详细教程
《使用ggplot2画图》 作者：Guangchuang Yu 原文链接：http://ygc.name/2014/05/11/use-ggplot2/ 1、Why use ggplot2 ggplo...
ggplot2作图详解7：主题（theme）设置
凡是和数据无关的图形设置内容理论上都可以归 主题类 但考虑到一些内容（如 坐标轴 ）的特殊性，可以允许例外的情况。主题的设置相当繁琐，很容易就占用了大量的作图时间，应尽量把这些东西简化，把注意力主要放...