GBrowse访问数据制备 Bioinformatics

GBrowse访问数据制备

什么样的数据,数据制备为什么格式,保存为什么样的形式,GBrowse进行怎样的设置,基因组图谱上就可以展示出来了。 要展示什么样的数据? 基因组注释数据,比如contig的拼接关系、功能基因的注释、基...
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Gbrowse权限管理 Bioinformatics

Gbrowse权限管理

或许你的数据没有发布,你只想部分人员访问你的Gbrowse,这就涉及到了权限管理,GBrowse提供了多种机制,你可以限制访问者的主机、IP地址、域名,或者只有通过用户名密码登陆后才可以访问。 Gbr...
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Gbrowse SNV突变频率图绘制 Genomics

Gbrowse SNV突变频率图绘制

基因组的某位置,会发生突变,或者说对于多个物种的个体进行测序的话,会发现许多位置不是稳定的只是某个碱基,而应该用频率表示,ACTG出现的频率,如果某个位置有出现两个以上碱基的可能性,我们就将这个位置称...
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gbrowse图形显示配置 Genomics

gbrowse图形显示配置

Gbrowse图谱可以分为三部分,overview,region,details,每一部分都可以显示0到多个的映描(track),对于trace的定义,可以分为以下几部分:  track显示的内容,显...
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