生物学家发现一种细菌感染正在美国西南部最常见的一类农业害虫的种群中肆虐。这种细菌（立克次氏体）是人类斑疹伤寒始作俑者的近亲。它的宿主叫甜薯粉虱 (sweet potato whitefly)，它们体型...
Popular Science“重女轻男”细菌扳倒进化平衡
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Popular Science生命起源：寻找第一个自我复制者
众所周知，生命起源于一个能自我复制的简单分子。——现在，我们认为我们知道怎么做出一个来。 很久以前，宇宙中产生了一颗围绕中等恒星运行的新行星，在距今40亿年前，这颗行星的表面逐渐冷却。当时，那里还是一...
Popular Science不确定性原理：进化如何两头下注
在变化的世界中，具有多样性是生存的关键。而进化似乎已经想到了一种不同寻常的方法产生更多的多样性。 一个人走进了一家酒吧。“我对进化有一种新的看法，”他宣布说，“你有什么东西可以让我把它写下来吗？”服务...
Popular Science非自然的选择：人类是如何驱动进化的
人类活动不仅造成了大灭绝──我们还是存活物种进化的最大驱动力。 墨西哥的祖克(Zoque)人每年都会举行一种仪式，他们把一种有毒植物研碎、混合起来，倒进当地岩洞中的一条河里（如下图）。所有中毒而漂上水...
GenomicsPGAP：泛基因组自动化分析的pipeline
PGAP（Pan-Genomes Analysis Pipeline） 是一款用于原核生物泛基因组学分析的自动化软件。它主要包括以下五大功能： 功能基因的聚类：根据序列相似性，将所有细菌中的功能基因按...
EvolutionKa/Ks与进化选择压力
在遗传学中，Ka/Ks或者dN/dS表示的是异意替换（Ka）和同意替换（Ks）之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变，反之则...