基因组注释分析主要包括哪些内容 ? Genomics

基因组注释分析主要包括哪些内容 ?

基因组注释包括以下方面的内容: (1) 重复序列的预测。通过比对已知的重复序列数据库,找出序列中包含的重复序列,识别类型并转化为N或者X,统计各种类型重复序列的分布。 (2) 编码基因的预测。通过将转...
阅读全文
Perl中的代码注释 Script

Perl中的代码注释

在写C,C++等程序的时候我们清楚利用 // 对单行代码进行注释,利用 /*  */ 可以对多长代码进行。但是在写Perl脚本的时候,我们往往只知道利用 # 来注释单行代码(当然perl里面的第一行的...
阅读全文
蛋白注释相关的工具 Bioinformatics

蛋白注释相关的工具

随着蛋白质数量的增加,对于这些蛋白质的分类与注释成为一个非常活跃的课题。这里将包含所有蛋白质序列的集合称为nr库,在nr库中,序列与序列的相似性是不均等的,当我们使用blast进行序列两两比对的时候,...
阅读全文
利用BioJava列出序列中的注释 Script

利用BioJava列出序列中的注释

当你读取象GenBank或EMBL这样的序列注释文件时,文件提供的不仅仅是序列本身还有一些更细节的序列信息。如果这个信息拥有位置的话,就可以当作是特征。如果这个信息是很通用的信息比如说是物种名称的话,...
阅读全文