在多元相关分析中，简单相关系数可能不能够真实的反映出变量X和Y之间的相关性，因为变量之间的关系很复杂，它们可能受到不止一个变量的影响。这个时候偏相关系数是一个更好的选择。 偏相关系数是在排除了其他变量...

在知道了分布函数和相应的统计量后怎样得到p-value呢?用R可以很容易的实现,如下(来自<统计建模和R软件>) P_value <- function(cdf,x,paramet,...

454测序返回的结果是sff格式的文件 #sffinfo(sff=test.sff,flow=T) #trim and bin sequences in flowgram #trim.flows(fl...

在plob论坛学习到不少知识，其中看到很多关于bioperl的文章，但是没有见到人们用biopython的。 所以在此分享一个简单代码，用来翻译核酸为蛋白序列。 注：需要Biopython库支持。 以...

一、权限对于目录的意义 1、首先要明白的是目录主要的内容是记录文件名列表和子目录列表，而不是实际存放数据的地方。 2、r权限：拥有此权限表示可以读取目录结构列表，也就是说可以查看目录下的文件名和子目录...

在这个例子中，我将向你展示如何避免不熟悉正则表达式的人常犯的一些错误。我们将尝试建立一个可以匹配浮点数的正则表达式。我们的正则表达式也应该匹配整数，以及整数部分（即0）没有给出来的浮点数。 乍看之下，...

python里的matplotlib是一个很强大的绘图软件包。可以绘制类似matlab和R软件效果的图样。这几天尝试着从原始数据得到一个热度图。就用了这个软件包。效果还好。虽然软件很庞大很复杂，但是遇...

做pca大体思路： snp raw data——转成plink二进制格式——然后用gcta生成matrix——然后用R作图 1、转二进制文件，先说把raw data转成plink的bfile二进制格式...

与大家分享一段利用R绘制维恩图的代码 [code lang="R"] library(plotrix) plot(0:10,seq(0,10,length=11),type='n',axes=F,xl...

今天看到群里面有人讨论关于Perl和Bioperl的学习问题。所以在这里与大家分享几个关于蛋白质翻译的Bioperl代码，大家可以将下面的函数copy到自己的程序中，就可以将其作为函数调用。 代码一：...