ggplot2是什么？ ggplot2是用于绘图的R语言扩展包，其理念根植于《Grammar of Graphics》一书。它将绘图视为一种映射，即从数学空间映射到图形元素空间。例如将不同的数值映射...
利用ggplot2画出各种漂亮图片详细教程
《使用ggplot2画图》 作者：Guangchuang Yu 原文链接：http://ygc.name/2014/05/11/use-ggplot2/ 1、Why use ggplot2 ggplo...
一千行MySQL学习笔记
/* 启动MySQL */ net start mysql /* 连接与断开服务器 */ mysql -h 地址 -P 端口 -u 用户名 -p 密码 /* 跳过权限验证登录MySQL ...
数据可视化完美指南-R-python
从数据到图表 有什么样的数据做什么样的图 作者提供了一张树状图，帮助并引导我们找到合适自己数据的的可视化方式 What kind of data do you have? Pick the main ...
使用R按照指定宽度计算覆盖率
如何使用R来按照bin（比如说每200碱基宽）来计数覆盖度并生成一个bedgraph文件呢？ 这个其实就是所谓的resample问题。可以使用?tileGenome来解决。 [code lang="R...
Bioconductor并行(parallel)运算
当我们进入大数据时代之后，并行运算就十分重要了。什么是大数据呢？引用一句流行语吧： Big data is hype. Everybody talks about big data; nobody k...
用R语言绘制韦恩图
R中提供了多个可用于绘制韦恩图的软件包，本文主要是介绍的是VennDiagram包。 安装VennDiagram包： install.packages("VennDiagram") 首先加载相应的软件...
ggplot2作图详解7：主题（theme）设置
凡是和数据无关的图形设置内容理论上都可以归 主题类 但考虑到一些内容（如 坐标轴 ）的特殊性，可以允许例外的情况。主题的设置相当繁琐，很容易就占用了大量的作图时间，应尽量把这些东西简化，把注意力主要放...
ggplot2作图详解6：标尺（scale）设置
标尺是ggplot2作图必需的元素，在《映射》一节提到了它的概念并简单进行了设置。在数据分析阶段，为避免陷入数据无关的垃圾坑，我们只需要设置映射，ggplot2自动配置合适的标尺并产生坐标和图例。这是...
ggplot2作图详解5：图层语法和图形组合
图层设置是ggplot2做图的关键。通过查看ggplot图形对象的数据结构我们了解到一个图层至少包含几何类型、统计类型和位置调整三方面的东西，当然数据和映射得首先建立。如果把ggplot2当成是太极，...