外显子组测序 Glossary

外显子组测序

外显子(exon)是真核生物基因的一部分,包含着合成蛋白质所需要的信息。全部外显子,称为“外显子组”(Exome)。外显子组测序(Exome sequencing)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子...
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何为假设性检验? Glossary

何为假设性检验?

准备再尝试一下,用大白话叙述一遍统计推断中最基础的东西(假设检验、P值、……),算是把这段时间的阅读和思考做个梳理(东西不难,思考侧重在如何表述和展示)。这次打算用一种“迂回的”表达方式,比如,本文从...
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P-value:一个注脚 Glossary

P-value:一个注脚

在上一篇文章里面简要介绍了p值的由来、计算和意义,这篇文章刚再次谈谈p-value。 P值就是当原假设为真时,比所得到的样本观察结果更极端的结果出现的概率。 The P-value is the pr...
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说说大家经常见到的p值 Glossary

说说大家经常见到的p值

在论坛,经常发现有人发关于P值的帖子,搜索了一下,一共有29个关于P值的帖子。的确,P值是最常用的一个统计学指标,几乎统计软件输出结果都有P值。了解P值的由来、计算和意义很有必要。 一、P值的由来 R...
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箱线图(boxplot)介绍 Glossary

箱线图(boxplot)介绍

箱线图(Boxplot)也称箱须图(Box-whisker Plot),是利用数据中的五个统计量:最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数与最大值来描述数据的一种方法。它也可以粗略地看出数据是否具有...
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SAM格式 Glossary

SAM格式

SAM是一种序列比对格式标准, 由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。 不同的软件,不同的时期,不同...
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内含子有什么用? Glossary

内含子有什么用?

作者:牛登科 三十年前问这个问题?你得到的答复是内含子没什么用,属于垃圾DNA或者说分子水平的寄生虫。 但是后来,一个又一个基因的可变剪接现象被发现。尤其是人类基因组测序完成后,人类基因组中没有发现原...
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操纵子有什么用? Glossary

操纵子有什么用?

作者:牛登科 学过生物学的人可能都知道乳糖操纵子。在大肠杆菌基因组中,乳糖分解、运输的三个基因连在一起,由前端共同的Promoter区域调节三个基因的表达。这三个基因,就像俗话中一根绳上的蚂蚱。操纵子...
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生物学重复与技术重复 Glossary

生物学重复与技术重复

在利用基因芯片或者RNA-seq做基因表达分析的时候,经常听说生物学重复和技术重复,这篇文章我们就来简单介绍二者的含义。 首先利用一张示意图对二者做一个简单介绍:   使用同一个抽提的RNA...
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