第一步：利用BLAST作比对 下载NCBI的nr数据库 NCBI的nr数据库一般可以从ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/ 下载，里面nr库有两种格式，一种是原始的nr蛋白...

1.Plain格式 A sequence in plain format may contain only IUPAC characters and spaces (no numbers!). Not...

下面是DNAstar软件中的SeqMan软件的使用方法介绍，利用SeqMan做少量数据序列拼接 Step1:打开Seqman软件 Step2:加入你要拼接的序列 点击Add sequences 查找并...

Velvet简单介绍： velvet是一款常用的基因组拼接软件，与soapdenovo一起常用于二代测序数据的处理，相对于soapdenovo拼接的完整性更好。他能同时支持fasta、fastq格式的...

首先引用一下官方对ABYSS的介绍： ABySS is a de novo, parallel, paired-end sequence assembler that is designed for ...

Inparanoid是一个寻找物种间直系同源基因的软件，同时相应的网站目前包含了100 organisms， 1687023 sequences。 Inparanoid单机版程序是一款非常优秀的寻找直...

PGAP（Pan-Genomes Analysis Pipeline） 是一款用于原核生物泛基因组学分析的自动化软件。它主要包括以下五大功能： 功能基因的聚类：根据序列相似性，将所有细菌中的功能基因按...

GenePattern是一个强大的基因组学分析平台，该平台整合了大量的基因表达分析、蛋白质组学分析、SNP分析、流式细胞分析、RNA-seq数据分析以及一些常规的生物信息学分析工具。 以下是官方介绍：...

  (1)  DNA模板问题（关键因素） (a) 非特异PCR产物     现象：每个峰下面都有其他颜色。 原因：PCR主带与杂带混在一起测序。 对策：凝胶电泳回收主带，重新测序。 (b) 非单克隆 ...

 Cap3简介 Huang, X. 和 Madan, A 开发的一套用于序列拼接的软件,此软件适用于小的数据集或 EST 拼接,它有如下特征： 利用正反向进行拼接，更正拼接错误、连接 contigs。...