影响3730测序质量的因素 Genomics

影响3730测序质量的因素

  (1)  DNA模板问题(关键因素) (a) 非特异PCR产物     现象:每个峰下面都有其他颜色。 原因:PCR主带与杂带混在一起测序。 对策:凝胶电泳回收主带,重新测序。 (b) 非单克隆 ...
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CAP3的使用方法 Genomics

CAP3的使用方法

 Cap3简介 Huang, X. 和 Madan, A 开发的一套用于序列拼接的软件,此软件适用于小的数据集或 EST 拼接,它有如下特征: 利用正反向进行拼接,更正拼接错误、连接 contigs。...
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hmmer的安装与使用 Genomics

hmmer的安装与使用

从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blas...
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