Script

利用BioJava翻译DNA序列或标志链

要将DNA翻译成蛋白必须执行下列步骤: 转录成RNA 获得标志链的密码子(三联子) 翻译成蛋白 大部分可以通过使用Biojava的Tools类的静态方法实现。下面的程序展示了这个过程。当然了,如果你的...
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Bioinformatics

测序峰图的基本知识

  测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件,峰图文件为Abi格式,用chromas软件(网上可下载)打开. 四种颜色的波形代表四种碱基的信号强度; 正常的峰图,波峰与波谷清晰...
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Genomics

GBrowse之频率直方图

GBrowse之频率直方图,有称为频率分布图,Generating Feature Frequency Histograms,用以展示这些统计信息,可以表意以下信息: 不同区段内基因组Gene或者SN...
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Genomics

gbrowse图形显示配置

Gbrowse图谱可以分为三部分,overview,region,details,每一部分都可以显示0到多个的映描(track),对于trace的定义,可以分为以下几部分:  track显示的内容,显...
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Script

release linux memory

用centos的会发现,有时候系统处于空闲状态,但是内存全部被消耗。 其实这事是一个假象,内存不是真实的被消耗而只是被用作缓存,当系统有程序运行这些内存还是能够用于程序运行的。 如果想尽快释放缓存,可...
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