MTD（http://mtd.cbi.ac.cn）是今年初发表在Brings in Bioinformatics上的哺乳动物动态转录本数据库（http://bib.oxfordjournals.org...
MTD(mammalian transcriptomic database)：哺乳动物动态转录本数据库
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MAFFT多重序列比对图解教程
【絮语】 一提到多重序列比对，很多人禁不住就想到ClustalW（Clustalx为ClustalW的GUI版），其实有一款多重序列比对软件－MAFFT，不论从比对速度（Muscle>MAFFT...
多重比对着色软件包 TEXshade 图解安装教程
【絮语】 TEXshade 是 Latex 的一个宏包，可以对 MSF或 ALN 格式的多重比对文件以不同的方式进行着色美化，并可以对重要的位置和区域作出标记。用 TEXshade软件包能做出来的多重...
多重序列比对的着色美化
【絮语】 多重比对是核苷酸和氨基酸序列分析的重要内容之一，通过多重比对，可以找出序列的保守区域，可以为分子进化分析提供依据。但由于软件的功能限制，一些比对软件生成的比对文件，如Clustalx的*.a...
图解核苷酸替代模型的选择 – MrMTgui 篇
【絮语】 在进行系统发育分析过程中，建树序列的进化模型选择是至关重要的一步，尤其对进化模型敏感的ML法和BI法，更是重中之重。对于一些新手而言，经常使用默认参数而忽略了这一关键步骤，从而导致建树结果的...
如何批量快速提交序列到 Genbank
【絮语】提交序列常见有两种方式，一种是Bankit ，另一种是Sequin，前者适合少量序列，后者则适合批量的序列。很多新人对 Sequin 望而却步，其实只要做好序列提交的三个文件准备工作，提交序列...
如何批量下载指定的序列？
【絮语】 下载序列简单不过，无非就是联网NCBI主页，选择数据库后输入AC号或GI号后直接下载。但是如何大批量下载，而且下载的序列是指定的AC或GI的呢？实现这一目的通常办法是借助一些生物软件的检索功...