转录组测序和数字表达谱测序有什么区别

转录组测序和数字表达谱测序相比,主要有如下不同:

第一,测序目标不同。

转录组测序可以测定特定组织中全部mRNA,而表达谱测序只是测定mRNA的酶切标签序列(21 bp);

第二,代表性不同。

数字表达谱测序只测定21bp序列,而转录组测序测定转录本全长,因而可以更准确地代表样品转录表达情况;

第三,应用范围不同。

转录组测序应用范围广泛,不仅可以检测表达量差异,而且可以发现新的转录本和可变剪切等。而表达谱测序只能粗略检测表达量差异,不能反映基因转录表达的特点和规律;

第四,参考序列要求不同。

转录组测序不仅可以适用于基因组序列已知的物种,而且也适用于基因组序列未知的物种。而表达谱测序只适用于基因组序列已知的物种。

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