转录组测序和数字表达谱测序有什么区别

  • A+
所属分类:Bioinformatics

转录组测序和数字表达谱测序相比,主要有如下不同:

第一,测序目标不同。

转录组测序可以测定特定组织中全部mRNA,而表达谱测序只是测定mRNA的酶切标签序列(21 bp);

第二,代表性不同。

数字表达谱测序只测定21bp序列,而转录组测序测定转录本全长,因而可以更准确地代表样品转录表达情况;

第三,应用范围不同。

转录组测序应用范围广泛,不仅可以检测表达量差异,而且可以发现新的转录本和可变剪切等。而表达谱测序只能粗略检测表达量差异,不能反映基因转录表达的特点和规律;

第四,参考序列要求不同。

转录组测序不仅可以适用于基因组序列已知的物种,而且也适用于基因组序列未知的物种。而表达谱测序只适用于基因组序列已知的物种。

avatar

发表评论

:?: :razz: :sad: :evil: :!: :smile: :oops: :grin: :eek: :shock: :???: :cool: :lol: :mad: :twisted: :roll: :wink: :idea: :arrow: :neutral: :cry: :mrgreen: