随着现在测序价格不断走低，转录组数据爆炸式增长，WGCNA被广泛应用于基因共表达网络分析。这里介绍一下WGCNA的全自动安装方法。 前提： 在电脑或者服务器中安装R version 3.0.0或更高的...
BioinformaticsWGCNA的全自动安装方法
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Bioinformatics
BioinformaticsWGCNA分析使用教程
WGCNA基本概念 加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法，可以用来鉴定...
TranscriptomicsWGCNA的各种安装方法
相关网络在生物信息学应用中得到越来越多的应用。例如，加权基因共表达网络分析是一种用于描述芯片基因间表达相关模式系统生物学方法。加权相关网络分析(WGCNA)可用于寻找高度相关基因的聚类(模块)。 相关...
Transcriptomics学习WGCNA总结
在转录组数据处理过程中我们经常会用到差异表达分析这一概念，通过比较不同处理或不同组织间基因表达量(FPKM)差异来寻找特异基因，但这前提是你的不同处理或不同组织样本较少，当不同处理或组织有较多样本，如...
Transcriptomics通俗易懂WGCNA
引文 每当我使用一个新的软件/算法时（相较于组内之前的研究），导师总喜欢问我背后的原理。她可以不懂，但我必须给她讲明白。 想给一个实验背景的人，讲明白一个算法的内在逻辑，属实不易。光是一颗聚类树，我就...
GenomicsWGCNA的总结
基本概念 WGCNA全名Weighted Gene Co-Expression Network Analysis，粗略翻译为加权基因共表达网络分析，因此可以归于共表达网络分析。 WGCNA主要运用于在...
BioinformaticsWGCNA加权基因共表达网络分析
序章 这个工具现在很火，高分文章用到很多。 加权基因共表达网络分析(WGCNA，Weighted gene co-expression network analysis) WGCNA能够从复杂数据中（...
BioinformaticsWGCNA知识点详解
什么是WGCNA分析？ WGCNA分析的全称是加权基因共表达网络分析（Weighted correlation network analysis），是用来描述不同样品之间基因关联模式的生物信息学分析方...
Genomics一文学会WGCNA分析
基本概念 WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系，以及网络中的核心基因。 适用于复杂的数据模式，推荐5组...