Bioinformaticsprimer3引物设计详解 关于Primer3的版权: 使用Primer3大致分为两类人:(1)第一类人为直接使用者,使用Primer3,一定程度上要求引用上述文献;(2)程序员,当将Primer3的源代码加入到你的程序中时,要... 10月30日23,7021 sequence 引物 阅读全文
GenomicsAlgorithms for Next-gen Sequence Analysis The field of next-gen sequence analysis is advancing so rapidly that new algorithms come out almost ... 06月06日1,395评论NGS sequence 阅读全文
Bioinformatics测序数据分析工具大全 目前有不少用于基因组装配和比对的程序和算法,但是该选哪一个呢?许多序列分析的专家认为,这取决于基因组的大小、读取有多长,以及采用的是哪种测序技术。通常,软件还需要优化,以满足每个实验室的独特需求。在此... 02月16日9,5082NGS RNAseq 阅读全文
Bioinformatics第二代测序数据处理工具软件汇总 Integrated solutions * CLCbio Genomics Workbench – de novo and reference assembly of Sanger, Roche F... 12月12日11,072评论NGS 生物信息 阅读全文
GenomicsmGene: Accurate Computational Gene Finding mgene 是一款基于机器学习的方法,从真核基因组序列中预测但白白编码基因的软件。 同时mgene.web是一款web服务程序。 mGene is a computationa... 12月03日1,671评论genome 基因组 阅读全文
Glossary序列以及序列比对中常见术语 有些你看着知道,其实让你说,又说不出多少;有些你以为自己知道,但你不知道自己仅仅了解了其中的一部分。许多概念,虽说只是一个词,但是其背后是一个专业的领域模型,每一个概念在不同的环境有着不同的故事,看见... 12月02日3,496评论alignment sequence 阅读全文
BioinformaticsFASTX-Toolkit FASTX-Toolkit是一款用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序,里面包含了丰富的FASTA/FASTQ文件格式转换、统计等命令。 下面是其功能介绍: FASTQ-t... 11月30日9,133评论fasta fastq 阅读全文
Glossary454 GS FLX测序原理 454生命科学公司所研发的新一代测序平台基于光纤微流体技术和包裹了待测DNA片段的乳化液滴技术(炸药中的表面活性剂来维持乳液的热稳定性)。基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Se... 11月26日29,642评论454 sequencing 阅读全文
BioinformaticsTranslatorX server:基于氨基酸序列的核酸比对工具 通常进行多序列比对的时候都是多条蛋白序列或者多条核酸序列进行比对。而TranslatorX是利用蛋白比对的结果对核酸序列进行比对的工具。 TranslatorX分为两个版本,其一是在线服务器,另外提供... 11月25日4,032评论alignment sequence 阅读全文
GlossaryFasta格式说明 序列的Fasta格式是最经常看到的格式之一。下面简介说明一下什么是FASTA格式。 Fasta格式开始于一个标识符:">",然后是一行描述,下面是一行行的序列。每一行最好不要超过80个字母。 如... 11月23日4,482评论fasta sequence 阅读全文