RNA-SeQC是一个计算一系列对RNA-Seq数据进行质量控制的计量学的java程序。输入内容可以是一个或者多个BAM文件。输出文件是则包括计量数据的HTML报告和tab delimited文件。这...

准备工作 下载velvet (1.105版本) wget http://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet/velvet_1.1.05.tgz ./ 解压： tar zxvf ...

新一代测序技术组装拼接软件velvet使用简介 目前用于新一代的测序的主要仪器有Illumina/Solexa的Genome Analyzer、ABI的Solid和Roche的454，它们都能高通量的...

Phrap ("phragment assembly program", or "phil's revised assembly program"), Phrap是由华盛顿大学分子生物技术学院的Phi...

用454测序得到的序列用newbler拼接的效果最好，而用短序列拼接软件velvet拼接效果很差，所以不能将454的原始reads和Illumina产生的reads合到一起后用velvet进行拼接。在...

SolexaQA 是一个基于unix开发的perl脚本程序，用于Solexa 测序的Reads质量评估以及低质量Reads过滤。 SolexaQA              从Fastq文件统计rea...