在现代分子进化研究中，根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断，将揭示出有关生物进化过程的顺序，有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。 对于一个完...
多重序列比对及系统发生树的构建
阅读全文
3.序列比对和数据库搜索(生物信息学教程系列)
生物信息学教程系列 第三章 3 序列比对和数据库搜索 比较是科学研究中最常见的方法，通过将研究对象相互比较来寻找对象可能具备的特性。在生物信息学研究中，比对是最常用和最经典的研究手段。 最常见的比对是...
Clustal的使用总结（Clustalx+Clustalw）
Clustal包括Clustalx和Clustalw（前者是图形化界面版本后者是命令界面），是生物信息学常用的多序列比对工具。最近在网上看到一篇关于clustal使用的介绍，里面对clustalx和c...
Clustal难道不能批量运行？
相信Clustal程序是大家耳熟能详的序列比对软件了。其中ClustalX是windows下图形化界面的版本，ClustalW是基于命令行的版本，后者是做生物信息中一般用的比较多，今天的主角就是Clu...
将序列比对的结果保存为漂亮的图片
多序列比对在分子生物学中是一个基本方法，用来发现特征序列，进行蛋白分类，证明序列间的同源性，帮助预测新序列二级结构与三级结构，确定PCR引物，以及在分子进化分析方面均有很大帮助，Clustal W（D...
几个多序列比对软件：Muscle,ClustalW和T-coffee的简单比较
ClustalW是现在用的最广和最经典的多序列比对软件, Muscle是速度最快的多序列比对之一,T-coffee是越来越受到欢迎的软件.它们各自有什么优点和缺点呢? ClustalW不仅可以用来做多...