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覆盖度

Script

使用R按照指定宽度计算覆盖率

如何使用R来按照bin(比如说每200碱基宽)来计数覆盖度并生成一个bedgraph文件呢? 这个其实就是所谓的resample问题。可以使用?tileGenome来解决。 [code lang="R...
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Glossary

深度(depth)与覆盖度(coverage)

假想实验 对长100bp的目标区域进行捕获测序:采用单端测序,每个read长5bp;总共得到了200个reads;把所有的reads比对到目标区域后,100bp的目标区域中有98bp的位置至少有1个r...
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