假想实验
对长100bp的目标区域进行捕获测序:采用单端测序,每个read长5bp;总共得到了200个reads;把所有的reads比对到目标区域后,100bp的目标区域中有98bp的位置至少有1个read覆盖到,换言之,剩余的2bp没有1个read覆盖。
深度(depth)
200 x 5 / 100 = 10
我们说这此测序的深度为10X。
覆盖度(coverage)
98 / 100 × 100% = 98%
我们说这次测序的覆盖度为98%。
对长100bp的目标区域进行捕获测序:采用单端测序,每个read长5bp;总共得到了200个reads;把所有的reads比对到目标区域后,100bp的目标区域中有98bp的位置至少有1个read覆盖到,换言之,剩余的2bp没有1个read覆盖。
200 x 5 / 100 = 10
我们说这此测序的深度为10X。
98 / 100 × 100% = 98%
我们说这次测序的覆盖度为98%。