单细胞测序方法比较 Genomics

单细胞测序方法比较

导读 在单细胞研究的大潮中,新的测序方法层出不穷。不过,很少有人对这些方法进行系统的比对。慕尼黑大学生物学家Wolfgang Enard最近领导团队,在小鼠胚胎干细胞的基因表达研究中比较了一些常用的单...
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ggtree美化进化树 Bioinformatics

ggtree美化进化树

研究基因功能的人建个树,需要找近缘物种、外类群十几至几十个物种,费N天的劲才能做个树。而宏基因组领域的人不用去收集其它物种,因为研究的对像本身就有几百到几千的物种,为了方便阅读或展示主要信息,我们反而...
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QIIME2官方帮助文档的中文版 Bioinformatics

QIIME2官方帮助文档的中文版

声明:本文为QIIME2官方帮助文档的中文版,由中科院遗传发育所刘永鑫博士翻译并亲测有效,文档翻译己获QIIME2团队官方授权。由于QIIME2更新频繁,如使用中遇到问题请访问QIIME2官方论坛阅读...
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关于ROC曲线,IDI和NRI Statistics

关于ROC曲线,IDI和NRI

(一)缘起  这几天,连续碰到多人咨询了两个同样的问题,这两个都是非常有意思的话题: 如何比较两个模型的预测效果?ROC的AUC值比较?IDI、NRI如何计算? 如何做危险因素评分预测模型?怎样将回归...
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进化树+图片:组合图的绘制 Evolution

进化树+图片:组合图的绘制

在一些高分文章中我们会看到类似下图这种添加了图片进化树,颜值高而且更直观。在之前已经介绍过进化树和条形图、热图、点状图、结构域示意图等的组合,但Evolview并不支持进化树和图片的组合。 (Natu...
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